Après une cinématique où vous voyez diverses catastrophes naturelles ( une crevasse, une forêt en feu, etc ), vous arrivez devant l'entrée de la Grotte Lapis. A peine arrêté, vous devez déjà reprendre votre route car vous entendez au loin vos poursuivants. Ce donjon de 14 étages n'est pas difficile. 

Une fois sorti du donjon, vous devez à nouveau repartir, car les autres ne sont pas très loin. Après les avoir semés, vous arrivez devant un volcan en éruption. Vous entendez les autres équipes de secours dire que c'est de la folie d'aller dans le Mont Ardentet que seuls les plus courageux continuent votre poursuite. 
Parlez au Kangourex de pierre si vous voulez sauvegarder ou utiliser la réserve. 
Vous avez le choix entre : 
- un petit donjon de 5 étages, le Passage Roc qui vous fera revenir au point de départ 
- ou alors le Mt Ardent. 
Ce donjon, avec essentiellement des Pokémon feu, est en deux parties. La première, après laquelle vous pourrez sauvegarder grâce à une statue Kangourex, est composée de treize étages. Au troisième étage de la troisième partie, vous rencontrez le deuxième des oiseaux légendaires : Sulfura. Celui-ci est furieux car il pense que c'est de votre faute si l'équilibre de la nature a été rompu. Une fois le combat terminé, il vous laisse partir, en vous disant qu'il attend de vous que vous résolviez le problème des catastrophes naturelles. 

Après avoir quitté le Mont Ardent, vous vous retrouvez dans une région couverte de neige. Vous tombez nez à nez avec un Absol qui part sans rien dire. Vous découvrez ensuite une forêt enneigée. Vous avez à nouveau le choix entre : 
- un donjon en boucle de quatre étages, le Passage Neige 
- ou alors la Forêt Givrée. 
Celle-ci a 9 étages et des Pokémon de types assez variés. A l'étage 6, vous entendez une voix, qui de la même façon que Sulfura, pense que c'est de votre faute si le vent glacial de la forêt s'est arrêté. Après l'étage neuf, vous avez une statue Kangourex pour sauvegarder et il vous reste à finir encore quatre autres étages, avant d'arriver devant le dernier des oiseaux : Artikodin. Celui-ci vous demande de repartir, sinon il devra vous éliminer. 
Une fois le combat fini, il vous explique que la neige de la forêt commence à fondre, ce qui n'était jamais arrivé auparavant. Juste avant que vous ne vous fassiez éliminer par l'oiseau en colère, l'Absol que vous aviez rencontré précédemment calme le légendaire en furie, qui lui aussi vous laisse partir à condition que vous trouviez un moyen de rétablir l'équilibre des choses. L'Absol rejoint votre équipe. 

Alors que vous continuez vers le nord, votre compagnon commence à douter du fait que vous puissiez trouver la vérité. 
Gardevoir apparaît et vous révèle que devant vous, se tient le Mont Glacial, là où réside Feunard qui attend l'arrivée de nos héros. Une fois de plus il y a une statue pour vous permettre d'accéder à la réserve et de sauvegarder. Vous avez le choix d'aller : 
- soit à nouveau au Passage Neige 
- soit au Mont Glacial. 
Après 15 étages, vous pouvez à nouveau sauvegarder. Il ne vous reste plus que 4 étages à traverser. Tous composés d'Oniglali qui vous rapportent 232 XP ( si une capacité est utilisée ), ce qui n'est pas négligeable. 

Une fois en haut, vous êtes rattrapé par [b)l'équipe d'Alakazam[/b]. Un combat commence, mais est très vite arrêté par Feunard en personne. Celui-ci explique en effet qu'un humain a été transformé en Pokémon suite à sa malédiction et que celui-ci est encore en vie, mais que cet humain n'est pas la cause du dérèglement du monde et qu'il ne s'agit pas de nous. Avant que Feunard ne vous explique, un tremblement de terre stoppe net la discussion. En effet, le Pokémon légendaire Groudon va être réveillé et l'équipe d'Alakazam part l'affronter afin de le calmer. Une fois arrivé sur la place, vous expliquez toute l'histoire aux villageois qui se mettent à la poursuite de Ectoplasma.